Periodo otomano
n 1522 los Turcos Otomanos conquistaron la ciudad luego de un segundo largo sitio. Se construyeron nuevos edificios: mesquitas, baños públicos y mansiones para los nuevos patrones. Los griegos fueron forzados a abandonar la ciudad fortificada y mudarse a los suburbios fuera de las murallas. En la era otomana, Rodas perdió su característica internacional. La principal actividad económica que la mantenía siguió siendo el comercio de productos agrícolas en el interior de la isla y con las pequeñas islas que la rodean.
Luego del establecimiento de la soberanía en la isla, los Turcos Otomanos repararon las fortificaciones dañadas, convirtieron muchas iglesias en mezquitas y transformaron las casas más grandes en mansiones privadas o edificios públicos. Estas transformaciones fueron un proceso largo que ayudaron a adaptar los edificios en una forma otomana de vida. Las fachadas del período de los caballeros con sus decoraciones esculpidas, los arcos de las puertas y la piedra desgastada de las murallas fueron enriquecidas por características aleatorias de la arquitectura otomana adaptada al clima y la cultura local. En este proceso muchos de los servicios arqueológicos de los edificios existentes fueron preservados. Se adicionaron las características como baños (usualmente en el fondo de los edificios) y los balcones de madera cerrados en las fachadas sobre las angostas calles. De esta forma muchos de los edificios del período de los Hospitalarios en la zona Medieval fueron bien preservados. El resultado es una mezcla de arquitectura oriental con imposiciones de arquitectura occidental sumado a los edificios más recientes con las características de la arquitectura local de ese tiempo.
En el siglo XIX con la declinación del Imperio Otomano fueron deteriorándose los barrios y sus edificios sumado a fuertes terremotos y las continuas plagas de la zona.